Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFX1Q12986 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFX1Q12986 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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