Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFRD2Q12894 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFRD2Q12894 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms