Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF5AQ12840 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF5AQ12840 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF5AQ12840 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms