Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMA1Q12791 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMA1Q12791 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMA1Q12791 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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