Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 ECM1YAL059W 639 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 YLR346CYLR346C 306 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 YMR010WYMR010W 1218 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 PIN2YOR104W 849 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 QCR2YPR191W 1107 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 snR19snR19 568 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 KIP2YPL155C 2121 nt5.27□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 HOT1YMR172W 2160 nt5.26□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 ORC5YNL261W 1440 nt5.26□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 TFB3YDR460W 966 nt5.26□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 CAB4YGR277C 918 nt5.26□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 EMP46YLR080W 1335 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 SIS2YKR072C 1689 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 MDR1YGR100W 2853 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 PXA1YPL147W 2613 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 IMG2YCR071C 441 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 UBC6YER100W 753 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 YHL049CYHL049C 816 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 MNN11YJL183W 1269 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 CPR6YLR216C 1116 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 YPL113CYPL113C 1191 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 GIP2YER054C 1647 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 ATR1YML116W 1629 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 PMA1YGL008C 2757 nt5.25□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 CLD1YGR110W 1338 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 YTA12YMR089C 2478 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 VID30YGL227W 2877 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 STE12YHR084W 2067 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 TOM40YMR203W 1164 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 NOP13YNL175C 1212 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 DSE3YOR264W 1293 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 GRE1YPL223C 507 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 NOB1YOR056C 1380 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 RKM4YDR257C 1485 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 SEC9YGR009C 1956 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 GDB1YPR184W 4611 nt5.24□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 NUP116YMR047C 3342 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 MSH1YHR120W 2880 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 SLO1YER180C-A 258 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 YOR292CYOR292C 930 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 PRP46YPL151C 1356 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 ATG32YIL146C 1590 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 THI20YOL055C 1656 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 AFT1YGL071W 2073 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 IML2YJL082W 2196 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 KAP114YGL241W 3015 nt5.23□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 SNM1YDR478W 597 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 GLE2YER107C 1098 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 MIM2YLR099W-A 264 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 YLR283WYLR283W 945 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 CSR1YLR380W 1227 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 HXT7YDR342C 1713 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 HXT6YDR343C 1713 nt5.22□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 YIL067CYIL067C 2037 nt5.21□□□□□ -1.57
SEC39Q12745 PCL8YPL219W 1479 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 FAA4YMR246W 2085 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 CAD1YDR423C 1230 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 PCT1YGR202C 1275 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 YKR075CYKR075C 924 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 YLL059CYLL059C 507 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 GTR1YML121W 933 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 SMA1YPL027W 738 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 MRL1YPR079W 1146 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 BRE2YLR015W 1518 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 MSC7YHR039C 1935 nt5.21□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 SNF3YDL194W 2655 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 MCM4YPR019W 2802 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 NDC1YML031W 1968 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 COX26YDR119W-A 201 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 SKI8YGL213C 1194 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 FMP48YGR052W 1110 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 IPI1YHR085W 1005 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 YBL029WYBL029W 1131 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 SAM4YPL273W 978 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 YPR109WYPR109W 885 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 YCL012CYCL012C 405 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 DED81YHR019C 1665 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 YOR1YGR281W 4434 nt5.2□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 ROT2YBR229C 2865 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 FAA3YIL009W 2085 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 GET3YDL100C 1065 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 YEL045CYEL045C 426 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 PRO3YER023W 861 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 PRP45YAL032C 1140 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 UBX7YBR273C 1311 nt5.19□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 YEL028WYEL028W 462 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 MRPL4YLR439W 960 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 SPS18YNL204C 903 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 RPS19BYNL302C 435 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 NAT5YOR253W 531 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 CBC2YPL178W 627 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 PCL10YGL134W 1302 nt5.18□□□□□ -1.58
SEC39Q12745 CLA4YNL298W 2529 nt5.18□□□□□ -1.58
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