Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSRP1Q08945 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSRP1Q08945 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms