Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DDR1Q08345 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDR1Q08345 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDR1Q08345 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms