Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP1-1Q07627 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP1-1Q07627 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
KRTAP1-1Q07627 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRTAP1-1Q07627 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KRTAP1-1Q07627 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-1Q07627 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP1-1Q07627 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms