Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4BQ07343 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDE4BQ07343 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4BQ07343 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms