Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAX8Q06710 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX8Q06710 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX8Q06710 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms