Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPB1Q06547 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GABPB1Q06547 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABPB1Q06547 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms