Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSME1Q06323 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSME1Q06323 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PSME1Q06323 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms