Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EXOSC9Q06265 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EXOSC9Q06265 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms