Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 COQ6YGR255C 1440 nt6.5□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YDR222WYDR222W 1248 nt6.5□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YPT32YGL210W 669 nt6.5□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 PRM9YAR031W 897 nt6.5□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 CWC27YPL064C 906 nt6.5□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YDC1YPL087W 954 nt6.5□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YPR015CYPR015C 744 nt6.5□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 UBS1YBR165W 834 nt6.5□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YIL067CYIL067C 2037 nt6.5□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 CBP1YJL209W 1965 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 ASH1YKL185W 1767 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 ACC1YNR016C 6702 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YEL020CYEL020C 1683 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 DFG5YMR238W 1377 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 MLF3YNL074C 1359 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 GIP1YBR045C 1920 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 KEL1YHR158C 3495 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 TIM21YGR033C 720 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 THI4YGR144W 981 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 BUD28YLR062C 378 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YLR326WYLR326W 723 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YNR042WYNR042W 429 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 DSC2YOL073C 969 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 GPI2YPL076W 843 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 UBP7YIL156W 3216 nt6.49□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 SCT1YBL011W 2280 nt6.48□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 RSM10YDR041W 612 nt6.48□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YHR022CYHR022C 771 nt6.48□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YKL107WYKL107W 930 nt6.48□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 RHO2YNL090W 579 nt6.48□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 PGA2YNL149C 390 nt6.48□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YSA1YBR111C 696 nt6.48□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YBR284WYBR284W 2394 nt6.48□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 ERG7YHR072W 2196 nt6.48□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YDR161WYDR161W 1164 nt6.47□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YDR282CYDR282C 1245 nt6.47□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 CDC43YGL155W 1131 nt6.47□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YIL077CYIL077C 963 nt6.47□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YMR010WYMR010W 1218 nt6.47□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 PRE7YBL041W 726 nt6.47□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YIM2YMR151W 438 nt6.47□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 SEC12YNR026C 1416 nt6.47□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 YFL034WYFL034W 3222 nt6.47□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 IFM1YOL023W 2031 nt6.47□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 RAD57YDR004W 1383 nt6.46□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 CTS2YDR371W 1536 nt6.46□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 TIP20YGL145W 2106 nt6.46□□□□□ -1.37
NSE3Q05541 SSK22YCR073C 3996 nt6.46□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 TRP4YDR354W 1143 nt6.46□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 VAM7YGL212W 951 nt6.46□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 CTL1YMR180C 963 nt6.46□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 YNL296WYNL296W 315 nt6.46□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 HFI1YPL254W 1467 nt6.46□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 CUS1YMR240C 1311 nt6.46□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 IRC6YFR043C 714 nt6.45□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 PDE1YGL248W 1110 nt6.45□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 YKR047WYKR047W 306 nt6.45□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 YKR104WYKR104W 921 nt6.45□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 PAU17YLL025W 375 nt6.45□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 YLR036CYLR036C 612 nt6.45□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 MRPS8YMR158W 468 nt6.45□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 snR3snR3 194 nt6.45□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 GAL10YBR019C 2100 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 APJ1YNL077W 1587 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 VMA2YBR127C 1554 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 HOF1YMR032W 2010 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 POP1YNL221C 2628 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 HEM3YDL205C 984 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 YDR336WYDR336W 945 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 SPO20YMR017W 1194 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 SPS18YNL204C 903 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 YPR098CYPR098C 486 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 DCC1YCL016C 1143 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 PRR2YDL214C 2100 nt6.44□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 RGD1YBR260C 2001 nt6.43□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 TUL1YKL034W 2277 nt6.43□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.43□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 YBL077WYBL077W 432 nt6.43□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 VPS68YOL129W 555 nt6.43□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt6.43□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 MET16YPR167C 786 nt6.43□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 AVT3YKL146W 2079 nt6.43□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 QDR1YIL120W 1692 nt6.42□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 PMA1YGL008C 2757 nt6.42□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 OKP1YGR179C 1221 nt6.42□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 YIL028WYIL028W 399 nt6.42□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 LEM3YNL323W 1245 nt6.42□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 KIP2YPL155C 2121 nt6.42□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 YHR177WYHR177W 1362 nt6.42□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 MET3YJR010W 1536 nt6.41□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 UTR4YEL038W 684 nt6.41□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 RPN12YFR052W 825 nt6.41□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 CIA2YHR122W 696 nt6.41□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 WSS1YHR134W 810 nt6.41□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 HOR7YMR251W-A 180 nt6.41□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 RAD7YJR052W 1698 nt6.41□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 TUB2YFL037W 1374 nt6.41□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 HAS1YMR290C 1518 nt6.4□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 PDH1YPR002W 1551 nt6.4□□□□□ -1.38
NSE3Q05541 NOT3YIL038C 2511 nt6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.2 ms