Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTK2Q05397 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms