Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OCA2Q04671 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OCA2Q04671 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms