Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 CUE2YKL090W 1332 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 YDR396WYDR396W 501 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 SOH1YGL127C 384 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 CIA2YHR122W 696 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 PAL1YDR348C 1500 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 RAD30YDR419W 1899 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 CEG1YGL130W 1380 nt5.51□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 DRS1YLL008W 2259 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 ARF2YDL137W 546 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 TRS23YDR246W 660 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 SAP30YMR263W 606 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 RRN9YMR270C 1098 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 CIN5YOR028C 888 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 CHL4YDR254W 1377 nt5.5□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 APM2YHL019C 1818 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 YDR133CYDR133C 336 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 YGL185CYGL185C 1140 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 YMR245WYMR245W 621 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 SED4YCR067C 3198 nt5.49□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 BRE2YLR015W 1518 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 FRT2YAL028W 1587 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 SFK1YKL051W 1062 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 NMA1YLR328W 1206 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 MET31YPL038W 534 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 UMP1YBR173C 447 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 GDT1YBR187W 843 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 ASK10YGR097W 3441 nt5.48□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 RXT3YDL076C 885 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 YJR085CYJR085C 318 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX2Q04228 APC4YDR118W 1959 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 TLG2YOL018C 1194 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 ATG7YHR171W 1893 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 ROT2YBR229C 2865 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 SLZ1YNL196C 897 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 PCL1YNL289W 840 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 TPS3YMR261C 3165 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 GMC1YDR506C 1827 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 FOX2YKR009C 2703 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 CBF5YLR175W 1452 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 TDA7YNL176C 1911 nt5.44□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 UBI4YLL039C 1146 nt5.44□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 YPL278CYPL278C 303 nt5.44□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 SPN1YPR133C 1233 nt5.44□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 RPO26YPR187W 468 nt5.44□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 STB3YDR169C 1542 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 GCN20YFR009W 2259 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 GSY1YFR015C 2127 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 YNG1YOR064C 660 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 NPT1YOR209C 1290 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 ENV9YOR246C 993 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 CLF1YLR117C 2064 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 UGA1YGR019W 1416 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 CPR4YCR069W 957 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 YGL072CYGL072C 360 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 ECT1YGR007W 972 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 YGR066CYGR066C 879 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 TYS1YGR185C 1185 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 REC114YMR133W 1287 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 ICY2YPL250C 411 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 PAP1YKR002W 1707 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 MGS1YNL218W 1764 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 SRP101YDR292C 1866 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 PSE1YMR308C 3270 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 CAF4YKR036C 1932 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 CPS1YJL172W 1731 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 YDR417CYDR417C 372 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 YER084WYER084W 387 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 NCS6YGL211W 1080 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 RFC2YJR068W 1062 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 STE7YDL159W 1548 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 UBX7YBR273C 1311 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5.4□□□□□ -1.54
UBX2Q04228 IMD3YLR432W 1572 nt5.4□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 SIT1YEL065W 1887 nt5.4□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 YGR125WYGR125W 3111 nt5.4□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 VPS72YDR485C 2388 nt5.4□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 AZR1YGR224W 1842 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 PEX19YDL065C 1029 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 AAD4YDL243C 990 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 TUB3YML124C 1338 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 SAP4YGL229C 2457 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 VMS1YDR049W 1899 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 EXO70YJL085W 1872 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 MSS116YDR194C 1995 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 KAR2YJL034W 2049 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 ALG6YOR002W 1635 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 YMR196WYMR196W 3267 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 SEC18YBR080C 2277 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 YDL012CYDL012C 324 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 HLJ1YMR161W 675 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 PDR16YNL231C 1056 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 DDC1YPL194W 1839 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 RAD57YDR004W 1383 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX2Q04228 ARO10YDR380W 1908 nt5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.7 ms