Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP4A11Q02928 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4A11Q02928 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4A11Q02928 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms