Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
TOP2BQ02880 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TOP2BQ02880 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC38.63■■■■□ 3.78
TOP2BQ02880 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390.8 ms