Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLH2Q02577 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLH2Q02577 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLH2Q02577 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms