Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DHODHQ02127 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DHODHQ02127 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DHODHQ02127 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DHODHQ02127 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DHODHQ02127 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DHODHQ02127 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DHODHQ02127 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DHODHQ02127 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms