Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1DQ01668 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1DQ01668 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms