Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F1Q01094 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F1Q01094 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms