Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK16Q00536 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK16Q00536 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK16Q00536 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms