Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PITPNAQ00169 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms