Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COG7P83436 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COG7P83436 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COG7P83436 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COG7P83436 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COG7P83436 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG7P83436 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG7P83436 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG7P83436 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COG7P83436 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG7P83436 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG7P83436 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG7P83436 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG7P83436 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG7P83436 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG7P83436 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG7P83436 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG7P83436 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG7P83436 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG7P83436 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG7P83436 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG7P83436 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG7P83436 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG7P83436 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG7P83436 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG7P83436 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG7P83436 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG7P83436 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COG7P83436 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG7P83436 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG7P83436 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG7P83436 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG7P83436 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG7P83436 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG7P83436 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG7P83436 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG7P83436 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG7P83436 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG7P83436 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG7P83436 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG7P83436 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG7P83436 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG7P83436 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG7P83436 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG7P83436 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG7P83436 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG7P83436 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG7P83436 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG7P83436 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG7P83436 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG7P83436 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COG7P83436 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG7P83436 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG7P83436 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG7P83436 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG7P83436 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG7P83436 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG7P83436 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG7P83436 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG7P83436 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG7P83436 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG7P83436 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG7P83436 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG7P83436 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG7P83436 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG7P83436 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COG7P83436 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG7P83436 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG7P83436 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG7P83436 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG7P83436 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG7P83436 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG7P83436 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG7P83436 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG7P83436 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG7P83436 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COG7P83436 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG7P83436 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG7P83436 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG7P83436 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG7P83436 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG7P83436 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG7P83436 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms