Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX1P78414 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX1P78414 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX1P78414 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX1P78414 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX1P78414 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX1P78414 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX1P78414 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX1P78414 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRX1P78414 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX1P78414 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX1P78414 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX1P78414 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX1P78414 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX1P78414 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRX1P78414 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX1P78414 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX1P78414 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX1P78414 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX1P78414 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX1P78414 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX1P78414 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX1P78414 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRX1P78414 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRX1P78414 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX1P78414 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX1P78414 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX1P78414 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX1P78414 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX1P78414 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRX1P78414 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX1P78414 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX1P78414 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX1P78414 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX1P78414 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX1P78414 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX1P78414 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX1P78414 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRX1P78414 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRX1P78414 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX1P78414 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX1P78414 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX1P78414 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX1P78414 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX1P78414 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX1P78414 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX1P78414 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX1P78414 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX1P78414 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX1P78414 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRX1P78414 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IRX1P78414 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX1P78414 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX1P78414 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX1P78414 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX1P78414 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX1P78414 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX1P78414 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX1P78414 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX1P78414 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX1P78414 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX1P78414 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRX1P78414 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX1P78414 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX1P78414 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX1P78414 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX1P78414 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX1P78414 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX1P78414 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRX1P78414 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX1P78414 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX1P78414 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms