Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HBBP68871 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HBBP68871 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HBBP68871 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HBBP68871 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HBBP68871 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HBBP68871 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HBBP68871 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBBP68871 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBBP68871 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBBP68871 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBBP68871 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HBBP68871 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBBP68871 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBBP68871 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBBP68871 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBBP68871 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBBP68871 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HBBP68871 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HBBP68871 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HBBP68871 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HBBP68871 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HBBP68871 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBBP68871 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBBP68871 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HBBP68871 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HBBP68871 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HBBP68871 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBBP68871 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HBBP68871 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HBBP68871 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HBBP68871 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HBBP68871 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms