Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2D2P62837 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D2P62837 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms