Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE2HP62256 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms