Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMC1P62191 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms