Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-21P61565 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-21P61565 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms