Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP4BP1P59074 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP4BP1P59074 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4BP1P59074 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4BP1P59074 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms