Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GEMIN4P57678 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GEMIN4P57678 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEMIN4P57678 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms