Protein–RNA interactions for Protein: P57076

C21orf59, UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59P57076 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C21orf59P57076 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C21orf59P57076 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms