Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OXCT1P55809 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OXCT1P55809 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms