Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD23BP54727 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23BP54727 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms