Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAG1P54619 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAG1P54619 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms