Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA8P53708 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA8P53708 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms