Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP2P53365 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP2P53365 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms