Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP98P52948 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP98P52948 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP98P52948 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP98P52948 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP98P52948 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP98P52948 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP98P52948 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP98P52948 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP98P52948 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP98P52948 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP98P52948 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP98P52948 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP98P52948 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP98P52948 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP98P52948 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP98P52948 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP98P52948 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP98P52948 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP98P52948 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP98P52948 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP98P52948 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP98P52948 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP98P52948 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP98P52948 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP98P52948 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP98P52948 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP98P52948 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP98P52948 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP98P52948 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP98P52948 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP98P52948 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP98P52948 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP98P52948 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP98P52948 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP98P52948 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP98P52948 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP98P52948 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP98P52948 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP98P52948 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP98P52948 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP98P52948 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP98P52948 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP98P52948 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP98P52948 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP98P52948 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP98P52948 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP98P52948 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP98P52948 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP98P52948 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP98P52948 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP98P52948 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP98P52948 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP98P52948 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP98P52948 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP98P52948 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP98P52948 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP98P52948 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP98P52948 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP98P52948 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP98P52948 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP98P52948 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP98P52948 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP98P52948 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP98P52948 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP98P52948 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP98P52948 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP98P52948 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP98P52948 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP98P52948 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP98P52948 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP98P52948 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP98P52948 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP98P52948 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP98P52948 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP98P52948 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP98P52948 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP98P52948 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP98P52948 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP98P52948 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP98P52948 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP98P52948 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP98P52948 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP98P52948 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP98P52948 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP98P52948 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP98P52948 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP98P52948 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP98P52948 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP98P52948 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP98P52948 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP98P52948 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP98P52948 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP98P52948 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP98P52948 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP98P52948 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP98P52948 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP98P52948 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms