Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF140P52738 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF140P52738 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms