Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGDP52209 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGDP52209 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGDP52209 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGDP52209 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PGDP52209 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGDP52209 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGDP52209 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGDP52209 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGDP52209 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGDP52209 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGDP52209 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGDP52209 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGDP52209 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGDP52209 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PGDP52209 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PGDP52209 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGDP52209 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGDP52209 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGDP52209 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGDP52209 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGDP52209 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGDP52209 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGDP52209 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGDP52209 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PGDP52209 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGDP52209 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PGDP52209 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGDP52209 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGDP52209 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGDP52209 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGDP52209 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGDP52209 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGDP52209 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PGDP52209 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGDP52209 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGDP52209 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGDP52209 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGDP52209 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGDP52209 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGDP52209 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGDP52209 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PGDP52209 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGDP52209 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGDP52209 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PGDP52209 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGDP52209 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGDP52209 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGDP52209 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGDP52209 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGDP52209 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGDP52209 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGDP52209 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGDP52209 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGDP52209 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGDP52209 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGDP52209 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGDP52209 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGDP52209 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGDP52209 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGDP52209 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGDP52209 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGDP52209 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGDP52209 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGDP52209 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PGDP52209 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGDP52209 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGDP52209 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGDP52209 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGDP52209 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGDP52209 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGDP52209 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PGDP52209 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGDP52209 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGDP52209 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGDP52209 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGDP52209 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGDP52209 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGDP52209 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGDP52209 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PGDP52209 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGDP52209 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGDP52209 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGDP52209 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PGDP52209 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PGDP52209 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGDP52209 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms