Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR1P51861 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR1P51861 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR1P51861 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR1P51861 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR1P51861 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDR1P51861 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR1P51861 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR1P51861 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR1P51861 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR1P51861 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR1P51861 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR1P51861 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR1P51861 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR1P51861 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR1P51861 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDR1P51861 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDR1P51861 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDR1P51861 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDR1P51861 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDR1P51861 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDR1P51861 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDR1P51861 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDR1P51861 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDR1P51861 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR1P51861 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR1P51861 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR1P51861 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR1P51861 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR1P51861 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR1P51861 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR1P51861 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR1P51861 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDR1P51861 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR1P51861 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR1P51861 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR1P51861 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR1P51861 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR1P51861 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR1P51861 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDR1P51861 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR1P51861 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR1P51861 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR1P51861 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR1P51861 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR1P51861 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR1P51861 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR1P51861 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR1P51861 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR1P51861 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR1P51861 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDR1P51861 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR1P51861 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR1P51861 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR1P51861 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR1P51861 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR1P51861 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR1P51861 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR1P51861 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR1P51861 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR1P51861 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR1P51861 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDR1P51861 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR1P51861 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR1P51861 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR1P51861 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR1P51861 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR1P51861 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR1P51861 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR1P51861 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR1P51861 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR1P51861 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR1P51861 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDR1P51861 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDR1P51861 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDR1P51861 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDR1P51861 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDR1P51861 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDR1P51861 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDR1P51861 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDR1P51861 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDR1P51861 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDR1P51861 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDR1P51861 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDR1P51861 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDR1P51861 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDR1P51861 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms