Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAMP7P51809 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAMP7P51809 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms