Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCN5P51795 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCN5P51795 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms