Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR3P51677 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR3P51677 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR3P51677 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR3P51677 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR3P51677 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR3P51677 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR3P51677 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR3P51677 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR3P51677 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR3P51677 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR3P51677 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR3P51677 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR3P51677 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR3P51677 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR3P51677 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR3P51677 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR3P51677 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR3P51677 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR3P51677 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR3P51677 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR3P51677 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR3P51677 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR3P51677 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR3P51677 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR3P51677 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR3P51677 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR3P51677 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR3P51677 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR3P51677 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR3P51677 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR3P51677 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR3P51677 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR3P51677 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR3P51677 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR3P51677 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR3P51677 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR3P51677 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR3P51677 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR3P51677 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR3P51677 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR3P51677 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR3P51677 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR3P51677 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR3P51677 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR3P51677 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR3P51677 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR3P51677 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR3P51677 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR3P51677 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR3P51677 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR3P51677 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR3P51677 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR3P51677 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR3P51677 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR3P51677 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR3P51677 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR3P51677 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR3P51677 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR3P51677 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR3P51677 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR3P51677 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR3P51677 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR3P51677 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR3P51677 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR3P51677 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR3P51677 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR3P51677 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR3P51677 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR3P51677 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR3P51677 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR3P51677 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR3P51677 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR3P51677 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR3P51677 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR3P51677 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR3P51677 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR3P51677 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR3P51677 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR3P51677 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR3P51677 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR3P51677 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR3P51677 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR3P51677 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR3P51677 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR3P51677 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR3P51677 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR3P51677 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR3P51677 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms