Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DAP3P51398 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DAP3P51398 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DAP3P51398 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DAP3P51398 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DAP3P51398 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DAP3P51398 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DAP3P51398 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DAP3P51398 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DAP3P51398 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DAP3P51398 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DAP3P51398 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DAP3P51398 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DAP3P51398 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DAP3P51398 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DAP3P51398 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DAP3P51398 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DAP3P51398 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DAP3P51398 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DAP3P51398 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DAP3P51398 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DAP3P51398 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DAP3P51398 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DAP3P51398 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DAP3P51398 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DAP3P51398 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DAP3P51398 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DAP3P51398 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DAP3P51398 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DAP3P51398 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DAP3P51398 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DAP3P51398 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DAP3P51398 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DAP3P51398 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DAP3P51398 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DAP3P51398 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DAP3P51398 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DAP3P51398 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DAP3P51398 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DAP3P51398 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DAP3P51398 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DAP3P51398 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DAP3P51398 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DAP3P51398 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DAP3P51398 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DAP3P51398 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DAP3P51398 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DAP3P51398 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DAP3P51398 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DAP3P51398 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DAP3P51398 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DAP3P51398 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DAP3P51398 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DAP3P51398 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DAP3P51398 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DAP3P51398 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DAP3P51398 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DAP3P51398 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DAP3P51398 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DAP3P51398 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DAP3P51398 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms