Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB28P51157 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB28P51157 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB28P51157 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB28P51157 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB28P51157 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB28P51157 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB28P51157 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB28P51157 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB28P51157 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB28P51157 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB28P51157 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB28P51157 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB28P51157 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB28P51157 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB28P51157 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB28P51157 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB28P51157 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB28P51157 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB28P51157 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB28P51157 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB28P51157 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB28P51157 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB28P51157 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB28P51157 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB28P51157 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB28P51157 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB28P51157 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB28P51157 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB28P51157 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB28P51157 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB28P51157 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB28P51157 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB28P51157 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB28P51157 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB28P51157 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB28P51157 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB28P51157 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB28P51157 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB28P51157 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB28P51157 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB28P51157 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB28P51157 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB28P51157 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB28P51157 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB28P51157 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB28P51157 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB28P51157 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB28P51157 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB28P51157 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB28P51157 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB28P51157 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB28P51157 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB28P51157 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB28P51157 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB28P51157 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB28P51157 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB28P51157 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB28P51157 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB28P51157 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB28P51157 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms