Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP3P50461 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms